洁净厂房建筑方式可分为土建结构和装配式两种，其中普遍采用装配式。
装配式洁净厂房系统主要由初，中，高三级空气过滤的空调送风回风和 排风系统；动力及照明系统；工作环境参数的监测报警消防和通讯系统；人流和物流系统；工艺管路系统；维护结构及静电地面处理等各方面所要求的实施内容组成，形成空调净化系统工程所包含的整个设备和器材的配套和建筑安装内容。
不论什么行业，对产品的质量和生产环境的要求都是越来越严格的，净化车间也将深入各行各业，这是当前的工业发展趋势。
如今的净化车间涉及到的行业如下：微电子、日用化妆品、打印包装、光学光电、化学生物、制药、医疗器械、洁净手术室、航空航天、涂装涂料、文物仓库等。因为净化车间工程能够控制空气中的污染物及有害气体在一定范围内，为产品生产制作供给了一个洁净的环境。
洁净厂房内一般除了设立洁净房间之外，还应配备产品制造所需的制造辅助房间，人员清洁和物料清洁用房间、公用动力设备用房等，因此洁净室建筑规划设计务必协调好、分配好洁净建筑内多种房间的平面、空间布置，尽量做到对大限度的平面、空问的利用。
在洁净厂房的设计中，建筑规划设计是一个关键的构成部分。洁净厂房建筑规划设计要综合性考量产品生产工艺流程标准及生产线设备特性、净化空调系统和室内气流流型及其多种管线系统分配等因素，开展建筑物的平面和剖视图设计。