使用目的不同：生物实验室是为了保护操作者和实验室外的人员不受感染。生物控制。普通洁净实验室是为了保护产品不受污染。室内环境控制。 实现方法不同：生物实验室相对大气为负压，对室内压力及相邻房间的压力梯度严格控制，控制室内气流流向。采用全新风送风，排风及送风均采用双风机系统，一用一备，自动投入运行。排风系统要加HAPE过滤器。自控要求较高。普通洁净实验室相对大气为正压且压力差值较小，对室内压力及相邻房间的压力梯度控制要求较低。一般采用新风+回风的送风系统，送风及排风系统均不用风机。排风系统不加HAPE过滤器。自控要求相对较低。 运行模式不同：生物实验室的运行模式一般有正常运行模式、值班运行模式、运行模式；根据实验室使用方式及方法的不同，对室内的条件控制及风量控制有所不同。一般洁净实验室的运行模式一般仅有正常运行模式，要求条件高的项目才会有值班运行模式，一般不会考虑运行模式。
三种常用洁净实验室净化空调系统
1、直流式净化空调系统
直流式系统就是不用回风循环系统，也就是直送直排系统，其能耗很大。这种系统一般适用于有致敏性的生产工艺（如青霉素分装工艺）、实验动物房、生物洁净室（实验室）及能形成交叉污染生产工艺。采用这种系统时应考虑余热的回收。
2、全循环式净化空调系统
全循环式系统即无新风供给，也无排风的系统。这种系统无新风负荷，很节能，但室内空气品质差，压差不好控制，一般适用于无人操作、值守的洁净室。
3、部分循环式净化空调系统
这是用得多的系统形式，也就是有部分回风参与循环的系统。在系统中，新风和回风混合经处理送到无尘洁净室内，回风的一部分用于系统循环，另一部分被排走。该系统压差易于控制，室内品质较好，能耗介于直流式系统与全循环式系统之间，适用于允许采用回风的生产工艺。
(1)注意洁净室周围的环境卫生，防止粉尘等物质产生；(2)注意检查初、中效的压差，当其压差大于初始压差的2倍时应对滤布进行清洗；(3)初、中滤布清洗时，不用洗衣粉，选择清洗剂。
我们根据上述要点完成15个食品行业洁净室的施工，且验收合格。无尘车间采用高压静电吸附除尘，静电场中的阴极线在高压静电的作用下，产生电晕放电，电晕层中产生大量的负离子，负离子在静电场的作用下，不断地向阳极运动。当空气中粉尘通过电场时，粉尘受到负离子的碰撞带上电荷，带上电荷后的粉尘同样受到静电场的作用，向阳极（集尘极）运动，到达阳极后释放电荷。食用菌净化车间快速实现空间环境净化,是传统空气净化投资的20%，又能达到百级净化标准，不用任何化学、没有化学药剂残留。一年节省的药剂，即可以买一台设备，适于标准化食用菌厂和栽培户冷却室、接种室、菇房。
生产车间应根据工艺流程进行布置，避免重复往返，防止原材料，半成品和成品的交叉污染和混合。
地面应铺以吸水、不透水、防滑、防腐的材料。它没有裂缝，易于清洗和。地面应有1%-2%的坡度和排水系统，保证排水畅通，地面无积水；车间下水道应有可靠的液封装置。
墙面应由不透水、不吸水、耐洗、防渗材料组成，表面光滑、无裂缝，刷色浅、、不易脱落、易于清洗、、。墙角应该是弧形的。
门应具有光滑，不吸水的表面，紧密关闭，并根据每个车间的实际需要设置防飞设施，如纱门，屏风，水幕和气帘。
窗台高度超过1米，内窗台向下倾斜45度。
天花板应防止灰尘堆积，霉菌生长和材料剥落，易于清洗，不凝结水。